В письме от 6 февраля 2014 г. № ГД-4-3/1984@ ФНС России указала, что «первичка» в электронном виде может подтверждать доходы и расходы для целей налогообложения. Такие документы должны по правилам Федерального закона № 63-ФЗ «Об электронной подписи» считаться равнозначными документам на бумажном носителе, подписанным собственноручной подписью.

Если документ в электронном виде составлен по формату, установленному ФНС России, то при истребовании документов он может быть передан в налоговый орган в электронном виде через Интернет.

Порядок выставления и получения счетов-фактур в электронной форме по ТКС с применением усиленной квалифицированной электронной подписи установлен приказом Минфина РФ от 25.04.2011 № 50н.

Счета-фактуры, выставленные в установленном порядке в электронном виде, хранятся налогоплательщиком в электронном виде без распечатки их на бумажном носителе. Хранение должно осуществляться в хронологическом порядке соответственно по мере их выставления (составления, в том числе исправления, если счета-фактуры не подлежат направлению покупателю либо если направленные продавцом покупателю счета-фактуры не получены покупателем) или получения. Это касается и корректировочных, и исправленных счетов-фактур. Если все правила обращения с электронными счетами-фактурами соблюдены, то они могут служить подтверждением вычетов по НДС.